E.V. Brazhnikov
List of publications
  1. Chirgadze Yu.N., Brazhnikov E.V. (1973) Intensity of the infrared amide I band of dipeptides in heavy water. Biopolymers. 12, 2185-2188.
  2. Chirgadze Yu.N., Brazhnikov E.V. (1974) Intensities and other spectral parameters of infrared amide bands in the α-helical structure. Biopolymers. 13, 1701-1712.
  3. Chirgadze Yu.N., Brazhnikov E.V., Nevskaya N.A. (1976) Intramolecular distortion of the α-helical structure in polypeptides. J. Mol. Biol. 102, 781-792.
  4. Brazhnikov E.V., Chirgadze Yu.N. (1978) The use of deuterium exchange to study the distortion of α-helices in proteins. J. Mol. Biol. 122, 127-135.
  5. Brazhnikov E.V., Chetverin A.B., Chirgadze Yu.N. (1978) Secondary structure of Na, K,-dependent adenosinetriphosphatase. FEBS Lett. 93, 125-128.
  6. Chetverin A.B., Brazhnikov E.V., Chirgadze Yu.N. (1979) Isolation and strucyiral properties of membrane-bound Na+, K+-adenosine triphosphatase from pig kidney. Biochemistry (Moscow) [in Russian]. 44, 945-952. // Четверин А.Б., Бражников Е.В., Чиргадзе Ю.Н. (1979) Выделение мембраносвязанной Na+, K+-аденозинтрифосфатазы из почек свиньи и изучение её структурных свойств. Биохимия. 44, 945-952.
  7. Troitsky A.V., Chirgadze Yu.N., Brazhnikov E.V. (1979) Study of conformational rearrangements of bacteriophage T4 lysozyme during its binding to the inhibitor. Biochemistry (Moscow) [in Russian]. 44, 1864-1876. // Троицкий А.В., Чиргадзе Ю.Н., Бражников Е.В. (1979) Исследование конформационных перестроек в лизоциме бактериофага T4 при связывании с ингибитором. Биохимия. 44, 1864-1876.
  8. Dolgikh D.A., Gilmanshin R.I., Brazhnikov E.V. et al. (1981) α-Lactalbumin compact state with fluctuating tertiary structure. FEBS Lett. 136, 311-315.
  9. Dolgikh D.A., Abaturov L.V., Brazhnikov E.V., Lebedev Yu.O., Chirgadze Yu.N., Ptitsyn O.B., (1983) Acid form of bovine carbonic anhydrase B: «molten globule» with secondary structure. Dokl. AN USSR [in Russian]. 272, 1481-1484. // Долгих Д.А., Абатуров Л.В., Бражников Е.В., Лебедев Ю.О., Чиргадзе Ю.Н., Птицын О.Б. (1983) Кислая форма карбоангидразы: «расплавленная глобула» с вторичной структурой. Докл. АН СССР. 272, 1481-1484.
  10. Chirgadze Yu.N., Nikonov S.V., Brazhnikov E.V. (1983) Crystallographic study of elongation factor G from Thermus thermophilus HB8. J. Mol. Biol. 168, 449-450.
  11. Chetverin A.B., Brazhnikov E.V. (1985) Do sodium and potassium forms of Na-, K-ATPase differ in their secondary structure? J. Biol. Chem. 260, 7817-7819.
  12. Dolgikh D.A., Abaturov L.P., Bolotina I.A., Brazhnikov E.V., Bychkova V.E., Gilmanshin R.I., Lebedev Yu.O., Semisotnov G.V., Tiktopulo E.I., Ptitsyn O.B. (1985) Compact state of a protein molecule with pronounced small-scale mobility: bovine α-lactalbumin. Eur. Biophys. J. 13, 109-121.
  13. Brazhnikov E.V., Chirgadze Yu.N., Dolgikh D.A., Ptitsyn O.B. (1985) Noncoopeative temperature melting of a globular protein without specific tertiary structure: acid form of bovine carbonic anhydrase B. Biopolymers. 24, 1899-1907.
  14. Chirgadze Yu.N., Nevskaya N.A., Fomenkova N.P., Nikonov S.V., Sergeev Yu.V., Brazhnikov E.V., Garber M.B., Lunin V.Yu., Urzhumzev A.G., Vernoslova E.A. (1986) Structure of gamma-crystallin IIIb from calf lens at 2.5 Å resolution. Dokl. AN USSR [in Russian]. 320, 488-491. // Чиргадзе Ю.Н., Невская Н.А., Фоменкова Н.П., Никонов С.В., Сергеев Ю.В., Бражников Е.В., Гарбер М.Б., Лунин В.Ю., Уржумцев А.Г., Вернослова Е.А. (1986) Пространственная структура гамма-кристаллина IIIв из хрусталика глаза телёнка при разрешении 2,5 Å. Докл. АН СССР. 290, 490-495.
  15. Chirgadze Yu., Fomenkova N., Brazhnikov E., Nikonov S., Garber M., Glover I. (1988/1989) Structural studies of elongation factor G from Thermus thermophilus. In: «Synchrotron Radiation», Apend Daresbury Ann. Report. Ed. SERS Daresbury, UK, 148.
  16. Chirgadze Yu., Nevskaya N., Vernoslova E., Nikonov S., Sergeev Yu., Brazhnikov E., Fomenkova N., Lunin V., Urzhumtsev A. (1991) Crystal structure of calf eye lens gamma-crystallin IIIb at 2.5 Å resolution: its relation to function. Exp. Eye Res. 53, 295-304.
  17. Chirgadze Yu.N., Brazhnikov E.V., Nikonov S.V., Fomenkova N.P., Garber M.B., Urzhumtsev A.G., Lunin V.Yu., Chirgadze N.Yu., Nekrasov Yu.V. (1991) Structure of ribosomal elongation factor from Thermus thermophilus at low resolution. Dokl. AN USSR [in Russian]. 320, 488-491. // Чиргадзе Ю.Н., Бражников Е.В., Никонов С.В., Фоменкова Н.П., Гарбер М.Б., Уржумцев А.Г., Лунин В.Ю., Чиргадзе Н.Ю., Некрасов Ю.В. (1991) Кристаллическая структура рибосомного фактора G из бактерий Thermus Thermophilus при низком разрешении. Докл. АН СССР. 320, 488-491.
  18. Aevarsson A., Al-Karadaghi S., Svensson L.A., Liljas A., Brazhnikov E. Chirgadze Yu., Garber M., Zheltonosova Yu. (1993/1994) The crystal structure of elongation factor G. In: «Synchrotron Radiation», Apend Daresbury Ann. Report. Ed. SERS Daresbury, UK, 99-100.
  19. Aevarsson A., Brazhnikov E., Garber M., Zheltonosova J., Chirgadze Yu., Al-Karadaghi S., Svensson L.A., Liljas A. (1994) Three-dimensional structure of the ribosomal translocase: elongation factor G from Thermus thermophilus. EMBO J. 13, 3669-3677.
  20. Aevarsson A., Svensson L.A., Liljas A., Brazhnikov E. Chirgadze Yu., Garber M., Fomenkova N., Zheltonosova Yu. (1994/1995) Structural analysis of thermus thermophilus elongation factor G. In: «Synchrotron Radiation», Apend Daresbury Ann. Report. Ed. SERS Daresbury, UK, 131-132.
  21. Liljas A., Aevarsson A., Al-Karadaghi S., Garber M., Zheltonosova J., Brazhnikov E. (1996) Crystallographic studies of elongation factor G. Biochem. Cell Biol. 73, 1209-1216.
  22. Brazhnikov E.V., Efimov A.V. (2001) Structure of α-α-hairpins with short connections in globular proteins. Mol. Biol. (Moscow). 35, 89-97. // Бражников Е.В., Ефимов А.В. (2001) Структура α-спиральных шпилек с короткими перетяжками в глобулярных белках. Молекуляр. биол. 35, 100-108.
  23. Brazhnikov E.V., Chirgadze Yu.N. (2001) Functionally important sites in elongation factor EF-Tu from Thermus aquaticus: Analysis of fine structural changes of Ef-Tu in complexes with guanosine 3'-diphosphate. Biofizika. [in Russian]. 46, 1027-1037. // Бражников Е.В., Чиргадзе Ю.Н. (2001) Функционально важные места в факторе элонгации EF-Tu из Thermus aquaticus: анализ тонких структурных изменений при связывании с ГТФ и ГДФ. Биофизика. 46, 1027-1037.
  24. Efimov A.V., Brazhnikov E.V. (2003) Relationship between intramolecular hydrogen bonding and solvent accessibility of side-chain donors and acceptors in proteins. FEBS Lett. 554, 389-393.
  25. Brazhnikov E.V., Efimov A.V. (2005) Analysis of interactions of buried polar side chains in β-proteins. Mol. Biol. (Moscow). 39, 769-776. // Бражников Е.В., Ефимов А.В. (2005) Анализ взаимодействий спрятанных полярных боковых цепей в β-белках. Молекуляр. биол., 39, 878-886.
  26. Brazhnikov E.V., Efimov A.V. (2007) Role of the structural context in selection of hydrophobic side-chain rotamers in a- and d-positions of α-helices. Mol. Biol. (Moscow). 41, 485-496. // Бражников Е.В., Ефимов А.В. (2007) Роль структурного контекста в отборе конформации гидрофобных боковых цепей, расположенных в a- и d-позициях α-спиралей. Молекуляр. биол. 41, 544-555.
  27. Brazhnikov E.V., Efimov A.V. (2010) Structure of β-β-hairpins closed into cycles by S-S-bridges. Mol. Biol. (Moscow). 44, 466-472. // Бражников Е.В., Ефимов А.В. (2010) Структура β-β-шпилек, замкнутых в циклы S-S-мостиками. Молекуляр. биол. 44, 529-534.
  28. Brazhnikov E.V., Kargatov A.M., Efimov A.V. (2016) Structure of looped regions in β-α- and α-β-arches in abCd-units of globular proteins. Matem. Biol. & Bioinf. [in Russian]. 11, № 2, 159-169. // Бражников Е.В., Каргатов А.М., Ефимов А.В. (2016) Структура петлевых участков в β-α- и α-β-дугах abCd-единиц в глобулярных белках. Матем. биол. и биоинф. 11, № 2, 159–169. doi: 10.17537/2016.11.159
  29. Boshkova E.A., Brazhnikov E.V., Efimov A.V. (2016) Relationship between structure and amino acid sequence of strongly twisted and coiled β-hairpins in globular proteins. Mol. Biol. (Moscow). 50, № 5, 777-782. // Бошкова Е.А., Бражников Е.В., Ефимов А.В. (2016) Взаимосвязь между структурой и аминокислотной последовательностью сильно скрученных и изогнутых β-шпилек в глобулярных белках. Молекуляр. биол. 50, № 5, 880-886. doi: 10.7868/S0026898416050049
  30. Kargatov A.M., Brazhnikov E.V., Efimov A.V. (2018) Structure and features of amino acid sequences of L-modules in SH3-like folds. Mol. Biol. (Moscow). 52, № 6, 929-936. // Каргатов А.М., Бражников Е.В., Ефимов А.В. (2018) L-Модули в SH3-подобных фолдах: структура и особенности последовательностей. Молекуляр. биол. 52, № 6, 1074-1081. doi: 10.1134/S0026898418060095
  31. Chirgadze Y.N., Battaile K.P., Likhachev I.V., Balabaev N.K., Gordon R.D., Romanov V., Lin A., Karisch R., Lam R., Ruzanov M., Brazhnikov E.V., Pai E.F., Neel B.G., Chirgadze N.Y. (2022) Signal transfer in human protein tyrosine phosphatase PTP1B from allosteric inhibitor P00058. J. Biomol. Struct. Dyn. 40, 13823-13832. doi: 10.1080/07391102.2021.1994879
  32. Brazhnikov E.V., Efimov A.V. (2022) П-like module in OB-fold: structure and features of sequences. Matem. Biol. & Bioinf. [in Russian]. 17, № 2, 441–451. // Бражников Е.В., Ефимов А.В. (2022) П-модуль в OВ-фолде: структура и особенности последовательностей. Матем. биол. и биоинф. 17, № 2, 441–451. doi: 10.17537/2022.17.441
  33. Chirgadze Y.N., Likhachev I.V., Balabaev N.K., Brazhnikov E.V. (2023) Molecular dynamics of α-helical structure: poly-L-glutamic acid. J. Biomol. Struct. Dyn. doi: 10.1080/07391102.2023.2183039
  34. Chirgadze Y.N., Likhachev I.V., Balabaev N.K., Brazhnikov E.V. (2023) Molecular dynamics of α-helical structure: poly-L-glutamic acid in water solution. Biophys. Rev. 15, 1425–1861 doi: 10.1007/s12551-023-01150-w
  35. Chirgadze Y.N., Likhachev I.V., Balabaev N.K., Brazhnikov E.V. (2024) Molecular dynamics of α-helix inside a protein with single helix. J. Biomol. Struct. Dyn. doi: 10.1080/07391102.2024.2308755
To return to the previous page  To the beginning of page
 
© PSMG IPR RAS 2006-2018
english

русский