A.V. Efimov
List of publications
  1. Lim V.I., Efimov A.V. (1976) The folding of protein chains. Prediction of tobacco mosaic virus protein tertiary structure. FEBS Lett. 69, 41-44.
  2. Lim V.I., Efimov A.V. (1977) The folding pathway for globins. FEBS Lett. 78, 279-283.
  3. Efimov A.V. (1977) Stereochemistry of packings of α-helices and β-structure in a compact globule. Dokl. AN USSR [in Russian]. 235, 699-702. // Ефимов A.B. (1977) Стереохимия упаковок α-спиралей и β-структуры в компактной глобуле. Докл. АН СССР. 235, 699-702.
  4. Lim V.I., Mazanov A.L., Efimov A.V. (1978) Stereochemical theory of the three-dimensional structure of globular proteins. I. Highly-helical intermediate structures. Mol. Biol. (Moscow) [in Russian]. 12, 206-213. // Лим В.И., Мазанов А.Л., Ефимов A.B. (1978) Стереохимическая теория пространственной структуры глобулярных белков. I. Высокоспиральные промежуточные структуры. Молекуляр. биол. 12, 206-213.
  5. Lim V.I., Mazanov A.L., Efimov A.V. (1978) Structure of ribosomal proteins. Prediction of the tertiary structure of proteins of the Escherichia coli ribosomal 30S subparticle. Dokl. AN USSR [in Russian]. 242, 1219-1222. // Лим В.И., Мазанов А.Л., Ефимов A.B. Структура рибосомных белков. Предсказание третичной структуры 30S-субчастицы рибосомы из Escherichia coli. Докл. АН СССР. 242, 1219-1222.
  6. Efimov A.V. (1978) Layer-structure of globin hydrophobic cores. Prediction of rotamers of hydrophobic side chains. Dokl. AN USSR [in Russian]. 243, 512-515. // Ефимов А.В. (1978) Слоевая структура гидрофобных ядер глобинов. Предсказание поворотных изомеров гидрофобных боковых цепей. Докл. АН СССР. 243, 512-515.
  7. Efimov A.V. (1979) Packing of α-helices in globular proteins. Layer-structure of globin hydrophobic cores. J. Mol. Biol. 134, 23-40.
  8. Efimov A.V. (1982) Role of connections in the formation of protein structures, containing 4-helical segments. Mol. Biol. (Moscow) [in Russian]. 16, 271-281. // Ефимов А.В. (1982) О роли перетяжек в образовании белковых структур, содержащих четыре спиральных участка. Молекуляр. биол. 16, 271-281.
  9. Efimov A.V. (1982) Super-secondary structure of beta-proteins. Mol. Biol. (Moscow) [in Russian]. 16, 799-806. // Ефимов А.В. (1982) Супервторичная структура β-белков. Молекуляр. биол. 16, 799-806.
  10. Efimov A.V. (1984) A novel super-secondary structure of proteins and the relation between the structure and the amino acid sequence. FEBS Lett. 166, 33-38.
  11. Efimov A.V. (1984) A new super-secondary protein structure: the alpha alpha-angle. Mol. Biol. (Moscow) [in Russian]. 18, 1524-1537. // Ефимов А.В. (1984) Новая супервторичная структура белков: αα-уголок. Молекуляр. биол. 18, 1524-1537.
  12. Efimov A.V. (1986) Standard conformations of a polypeptide chain in irregular protein regions. Mol. Biol. (Moscow) [in Russian]. 20, 250-260. // Ефимов А.В. (1986) Стандартные конформации полипептидной цепи в нерегулярных участках белков. 20, 250-260.
  13. Efimov A.V. (1986) Standard structures in protein molecules. I. Alpha-beta hairpins. Mol. Biol. (Moscow) [in Russian]. 20, 329-339. // Ефимов А.В. (1986) Стандартные структуры в белковых молекулах. I. α-β-Шпильки. Молекуляр. биол. 20, 329-339.
  14. Efimov A.V. (1986) Standard structures in protein molecules. II. Beta-alpha hairpins. Mol. Biol. (Moscow) [in Russian]. 20, 340-345. // Ефимов А.В. (1986) Стандартные структуры в белковых молекулах. II. β-α-Шпильки. Молекуляр. биол. 20, 340-345.
  15. Efimov A.V. (1987) Protein stability to the effect of denaturing agents and elevated temperature is directly proportional to the fraction of hydrophobic residues in its molecule. Mol. Biol. (Moscow) [in Russian]. 21, 62-72. // Ефимов А.В. (1987) Устойчивость белков к действию денатурирующих агентов и повышенной температуры прямо пропорциональна доле гидрофобных остатков в их молекулах. Молекуляр. биол. 21, 62-72.
  16. Efimov A.V. (1987) Pseudo-homology of protein standard structures formed by two consecutive β-strands. FEBS Lett. 224, 372-376. // Ефимов А.В. (1987) Псевдогомология стандартных структур, образованных двумя соседними по цепи β-тяжами. В сборнике «Структура и биосинтез белков», Пущино, 62-70.
  17. Mesyanzhinov V.V., Peletskaya E.N., Zhdanov V.M., Efimov A.V., Finkelstein A.V., Ivanovsky D.I. (1987) Prediction of secondary structure, spatial organization and distribution of antigenic determinants for hepatitis A virus proteins. J. Biomol. Struct. Dyn. 5, 447-458.
  18. Altshtein A.D., Efimov A.V. (1988) Physico-chemical basis of the genetic code origin: stereochemical analysis of interactions of amino acids and nucleotides based on the progene hypothesis. Mol. Biol. (Moscow) [in Russian]. 22, 1411-1429. // Альтштейн А.Д., Ефимов А.В. (1988) Физико-химическая основа происхождения генетического кода: стереохимический анализ взаимодействия аминокислот и нуклеотидов на основе гипотезы прогенов. Молекуляр. биол. 22, 1411-1429.
  19. Efimov A.V. (1990) Long irregular regions in proteins as combinations of small standard structures. Mol. Biol. (Moscow) [in Russian]. 24, 851-858. // Ефимов А.В. (1990) Длинные нерегулярные участки в белках как комбинации небольших стандартных структур. Молекуляр. биол. 24, 851-858.
  20. Fedorov O.V., Efimov A.V. (1990) Flagellin as an object for supramolecular engineering. Protein Eng. 3, 411-413.
  21. Efimov A.V. (1991) Long and mediumsize irregular regions in proteins as combinations of small standard structures. In: «Molecular Conformation and Biological Interactions» (P. Balaram & S. Ramaseshan, eds.). Indian Academy of Sciences, 19-29.
  22. Efimov A.V. (1991) Structure of α-α-hairpins with short connections. Protein Eng. 4, 245-250.
  23. Efimov A.V. (1991) Structure of coiled β-β-hairpins and β-β-corners. FEBS Lett. 284, 288-292.
  24. Gedrovich A., Shishkov A., Goldanskii V., Baratova L., Grebenshchikov N., Efimov A. (1991) Modelling protein three-dimensional structure using tritium planigraphy. Eur. Biophys. J. 19, 283-286.
  25. Efimov A.V. (1992) A novel super-secondary structure of β-proteins: A triple-strand corner. FEBS Lett. 298, 261-265.
  26. Efimov A.V. (1992) L-shaped structure from two alpha-helices with a proline residue between them. Mol. Biol. (Moscow) [in Russian]. 26, 1370-1376. // Ефимов А.В. (1992) L-образная структура из двух α-спиралей с остатком пролина между ними. Молекуляр. биол. 26, 1370-1376.
  27. Baratova L.A., Grebenshchikov N.I., Dobrov E.N., Gedrovich A.V., Kashirin I.A., Shishkov A.V., Efimov A.V., Järvekülg L., Radavsky Yu.L., Saarma M. (1992) The organization of potato virus X coat proteins in virus particles studied by tritium planigraphy and model building. Virology. 188, 175-180.
  28. Efimov A.V. (1993) Patterns of loop regions in proteins. Curr. Opin. Struct. Biol. 3, 379-384.
  29. Efimov A.V. (1993) Standard structures in proteins. Prog. Biophys. Molec. Biol. 60, 201-239.
  30. Efimov A.V. (1993) Super-secondary structures involving triple-strand β-sheets. FEBS Lett. 334, 253-256.
  31. Efimov A.V. (1994) Super-secondary structures in proteins. In: «Protein Structure by Distance Analysis» (H. Bohr & S. Brunak, eds.). IOS Press and Ohmsha, Amsterdam-Oxford-Washington DC, Tokyo-Osaka-Kyoto, 187-200.
  32. Efimov A.V. (1994) Common structural motifs in small proteins and domains. FEBS Lett. 355, 213-219.
  33. Efimov A.V. (1994) Favoured structural motifs in globular proteins. Structure. 2, 999-1002.
  34. Efimov A.V. (1995) Structural similarity between two-layer α/β- and β-proteins. J. Mol. Biol. 245, 402-415.
  35. Efimov A.V. (1996) A structural tree for α-helical proteins containing α-α-corners and its application to protein classification. FEBS Lett. 391, 167-170.
  36. Efimov A.V. (1997) Structural trees for protein superfamilies. Proteins. 28, 241-261.
  37. Efimov A.V. (1997) New structural motifs in alpha-helical proteins. Russian Journal of Bioorganic Chemistry [in Russian]. 23, 243-250. // Ефимов А.В. (1997) Новые структурные мотивы в α-спиральных белках. Биоорг. хим. 23, 243-250.
  38. Efimov A.V. (1997) A structural tree for proteins containing 3β-corners. FEBS Lett. 407, 37-41.
  39. Efimov A.V. (1998) Architecture of compact three alpha-helical structures. Russian Journal of Bioorganic Chemistry [in Russian]. 24, 517-522. // Ефимов А.В. (1998) Архитектура компактных структур из трёх α-спиралей. Биоорг. хим. 24, 517-522.
  40. Efimov A.V. (1998) A structural tree for proteins containing S-like β-sheets. FEBS Lett. 437, 246-250.
  41. Efimov A.V. (1999) Complementary packing of α-helices in proteins. FEBS Lett. 463, 3-6.
  42. Brazhnikov E.V., Efimov A.V. (2001) Structure of α-α-hairpins with short connections in globular proteins. Mol. Biol. (Moscow). 35, 89-97. // Бражников Е.В., Ефимов А.В. (2001) Структура α-спиральных шпилек с короткими перетяжками в глобулярных белках. Молекуляр. биол. 35, 100-108.
  43. Baratova L.A., Efimov A.V., Dobrov E.N., Fedorova N.V., Hunt R., Badun G.A., Ksenofontov A.L., Torrance L., Jarvekulg L. (2001) In situ spatial organization of potato virus A coat protein subunits as assessed by tritium bombardment. J. Virology. 75, 9696-9702.
  44. Kondratova M.S., Efimov A.V. (2002) Systematic analysis of buried polar side chains and their interactions in α-helical proteins. Mol. Biol. (Moscow). 36, 117-123. // Кондратова М.С., Ефимов А.В. (2002) Систематический анализ спрятанных полярных боковых цепей и их взаимодействий в α-спиральных белках. Молекуляр. биол. 36, 144-151.
  45. Efimov A.V. (2003) Packing of amphipathic α-helices in proteins. In «Protein Structures: Kaleidoscope of Structural Propeties and Functions» (V.N. Uversky, ed.). Research Signpost, India, 17-32.
  46. Efimov A.V., Brazhnikov E.V. (2003) Relationship between intramolecular hydrogen bonding and solvent accessibility of side-chain donors and acceptors in proteins. FEBS Lett. 554, 389-393.
  47. Efimov A.V., Kondratova M.S. (2003) A comparative analysis of interhelical polar interactions of various α-helix packings in proteins. Mol. Biol. (Moscow). 37, 440-445. // Ефимов А.В., Кондратова М.С. (2003) Сравнительный анализ межспиральных полярных взаимодействий в различных упаковках α-спиралей в белках. Молекуляр. биол. 37, 515-521.
  48. Efimov A.V. (2004) Structural trees of globular proteins. Usp. Biol. Chem. [in Russian]. 44, 109-132. // Ефимов А.В. (2004) Структурные деревья глобулярных белков. Усп. биол. хим. 44, 109-132.
  49. Dobrov E.N., Efimov A.V., Baratova L.A. (2004) Investigation of helical plant virus ribonucleoprotein structures with the help of tritium planigraphy and theoretical modeling. Mol. Biol. (Moscow) [in Russian]. 38, 945-958. // Добров Е.Н., Ефимов А.В., Баратова Л.А. (2004) Исследование структуры рибонуклеопротеидов спиральных вирусов растений методами тритиевой планиграфии и теоретического моделирования. Молекуляр. биол. 38, 945-958.
  50. Klyachko N.L., Shchedrina V.A., Efimov A.V., Kazakov S.V., Gazaryan I.G., Kristal B.S., Brown A.M. (2005) pH-Dependent substrate preference of pig heart lipoamide dehydrogenase varies with oligomeric state: response to mitochondrial matrix acidification. J. Biol. Chem. 280, 16106-16114.
  51. Brazhnikov E.V., Efimov A.V. (2005) Analysis of interactions of buried polar side chains in β-proteins. Mol. Biol. (Moscow). 39, 769-776. // Бражников Е.В., Ефимов А.В. (2005) Анализ взаимодействий спрятанных полярных боковых цепей в β-белках. Молекуляр. биол., 39, 878-886.
  52. Kolosov P., Frolova L, Seit-Nebi A. Dubovaya V. Kononenko A. Oparina N., Justesen J., Efimov A., Kisselev L. (2005) Invariant amino acids essential for decoding function of polypeptide release factor eRF1. NAR. 33, 6418-6425.
  53. Brazhnikov E.V., Efimov A.V. (2007) Role of the structural context in selection of hydrophobic side-chain rotamers in a- and d-positions of α-helices. Mol. Biol. (Moscow). 41, 485-496. // Бражников Е.В., Ефимов А.В. (2007) Роль структурного контекста в отборе конформации гидрофобных боковых цепей, расположенных в a- и d-позициях α-спиралей. Молекуляр. биол. 41, 544-555.
  54. Efimov A.V. (2007) A mechanism of selection of side-chain rotamers in α-helices. Biochemistry (Moscow). 72, 188-191. // Ефимов А.В. (2007) Механизм отбора поворотных изомеров боковых цепей в α-спиралях. Биохимия 72, 223-227.
  55. Kargatov A.M., Efimov A.V. (2007) Side-chain rotamers in protein α-α-hairpins and a mechanism of their selection. Mol. Biol. (Moscow). 41, 797-805. // Каргатов А.М., Ефимов А.В. (2007) Поворотные изомеры боковых цепей в α-α-шпильках белков и механизм их отбора. Молекуляр. биол. 41, 876-884. doi: 10.1134/S0026893307050135
  56. Kondratova M.S., Efimov A.V. (2007) The effect of the structural context on specificity of polar interactions in proteins. In: «Recent Advances in Structural Bioinformatics» (A.G. de Brevern, ed.). Research Signpost, India, 57-68.
  57. Dobrov E.N., Nemykh M.A., Lukashina E.V., Baratova L.A., Drachev V.A., Efimov A.V. (2007) Modified model of potato virus X coat protein structure. Mol. Biol. (Moscow) [in Russian]. 41, 706-710. // Добров Е.Н., Немых М.А., Лукашина Е.В., Баратова Л.А., Драчёв В.А., Ефимов А.В. (2007) Модифицированная модель структуры белка оболочки X-вируса картофеля. Молекуляр. биол. 41, 706-710.
  58. Nemykh M.A., Efimov A.V., Novikov V.K., Orlov V.N., Arutyunyan A.M., Drachev V.A., Lukashina E.V., Baratova L.A., Dobrov E.N. (2008) One more probable structural transition in potato virus X virions and a revised model of the virus coat protein structure. Virology. 373, 61-71.
  59. Gordeev A.B., Kondratova M.S., Efimov A.V. (2008) Novel structural tree for β-proteins containing abcd-units. Mol. Biol. (Moscow). 42, 285-288. // Гордеев А.Б., Кондратова М.С., Ефимов А.В. (2008) Новое структурное древо β-белков, содержащих abcd-единицы. Молекуляр. биол. 42, 323-326.
  60. Efimov A.V. (2008) Structural trees for proteins containing φ-motifs. Biochemistry (Moscow). 73, 23-28. // Ефимов А.В. (2008) Структурные деревья белков, содержащих φ-мотивы. Биохимия. 73, 29-35.
  61. Efimov A.V. (2008) Modeling of protein structures with structural trees. Journal of Siberian Federal University. Biology [in Russian]. 3, 226-247. // Ефимов А.В. (2008) Моделирование белковых структур с помощью структурных деревьев. Журнал СФУ. Биология 3, 226-247.
  62. Gordeev A.B., Efimov A.V. (2009) Novel structural tree for (α + β)-proteins containing abCd-units. Mol. Biol. (Moscow). 43, 480-484. // Гордеев А.Б., Ефимов А.В. (2009) Новое структурное древо (α + β)-белков, содержащих abCd-единицы. Молекуляр. биол. 43, 521-526.
  63. Efimov A.V., Spirin A.S. (2009) Intramolecular triple helix as a model for regular polyribonucleotide (CAA)(n). Biochem. Biophys. Res. Commun. 388, 127-130.
  64. Makarov V.V., Rybakova E.N., Efimov A.V., Dobrov E.N., Serebryakova M.V., Solovyev A.G., Yaminsky I.V., Taliansky M.E., Morozov S.Y., Kalinina N.O. (2009) Domain organization of the N-terminal portion of hordeivirus movement protein TGBp1. J. Gen. Virol. 90, 3022-3032.
  65. Brazhnikov E.V., Efimov A.V. (2010) Structure of β-β-hairpins closed into cycles by S-S-bridges. Mol. Biol. (Moscow). 44, 466-472. // Бражников Е.В., Ефимов А.В. (2010) Структура β-β-шпилек, замкнутых в циклы S-S-мостиками. Молекуляр. биол. 44, 529-534.
  66. Kargatov A.M., Efimov A.V. (2010) A novel structural motif and structural trees for proteins containing it. Biochemistry (Moscow). 75, 249-256. // Каргатов А.М., Ефимов А.В. (2010) Новый структурный мотив и структурные деревья содержащих его белков. Биохимия, 75, 305-312. doi: 10.1134/S0006297910020161
  67. Gordeev A.B., Kargatov A.M., Efimov A.V. (2010) PCBOST: Protein classification based on structural trees. Biochem. Biophys. Res. Commun. 397, 470-471. doi: 10.1016/j.bbrc.2010.05.136
  68. Boshkova E.A., Efimov A.V. (2010) Structures closed into cycles in proteins containing 3β-corners. Biochemistry (Moscow). 75, 1258-1263. // Бошкова Е.А., Ефимов А.В. (2010) Замкнутые в циклы структуры в белках, содержащих 3β-уголки. Биохимия. 75, 1417-1423.
  69. Efimov A.V. (2010) Structural motifs are closed into cycles in proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 399, 412-415.
  70. Efimov A.V. (2011) Structures closed into cycles in globular proteins. Biochemistry (Moscow). 76, 1385-1390. // Ефимов А.В. (2011) Замкнутые в циклы структуры в глобулярных белках. Усп. биол. хим. 51, 25-36.
  71. Gordeev A.B., Efimov A.V. (2013) Modeling of folds and folding pathways for some protein families of (α + β)- and α/β-classes. J. Biomol. Struct. Dyn. 31, 4-16.
  72. Efimov A.V. (2013) Super-secondary structures and modeling of protein folds. Methods Mol. Biol. 932, 177-189.
  73. Efimov A.V. (2013) Strongly twisted and coiled β-hairpins and their role in protein folding. In: «Biomolecular Forms and Functions» (M. Bansal & N. Srinivasan, eds.). IISc Press & World Scientific, India, 312-319.
  74. Rudnev V.R., Pankratov A.N., Kulikova L.I., Dedus F.F., Tikhonov D.A., Efimov A.V. (2013) Recognition and stability analysis of α-α-corner type structural motifs in globular proteins. Matem. Biol. & Bioinf. [in Russian]. 8, 398-406. // Руднев В.Р., Панкратов А.Н., Куликова Л.И., Дедус Ф.Ф., Тихонов Д.А., Ефимов А.В. (2013) Распознавание и анализ устойчивости структурных мотивов типа α-α-уголок в глобулярных белках. Матем. биол. и биоинф. 8, 398-406.
  75. Boshkova E.A., Gordeev A.B, Efimov A.V. (2014) A novel structural tree for wrap-proteins, a subclass of (α+β)-proteins. J. Biomol. Struct. Dyn. 32, 222-225. doi: 10.1080/07391102.2012.760107
  76. Efimov A.V., Boshkova E.A. (2014) Two mechanisms of protein folding: theoretical analysis. Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 40, 612–619. // Ефимов А.В., Бошкова Е.А. (2014) Два механизма сворачивания белков: теоретический анализ. Биоорг. хим. 40, 665–672.
  77. Rudnev V.R., Pankratov A.N., Kulikova L.I., Dedus F.F., Tikhonov D.A., Efimov A.V. (2014) Conformational analysis of α-α-corner type structural motifs in computational experiment of molecular dynamics. Matem. Biol. & Bioinf. [in Russian]. 9, 575-584. // Руднев В.Р., Панкратов А.Н., Куликова Л.И., Дедус Ф.Ф., Тихонов Д.А., Ефимов А.В. (2014) Конформационный анализ структурных мотивов типа α-α-уголок в вычислительном эксперименте молекулярной динамики. Матем. биол. и биоинф. 9, 575-584.
  78. Brazhnikov E.V., Kargatov A.M., Efimov A.V. (2016) Structure of looped regions in β-α- and α-β-arches in abCd-units of globular proteins. Matem. Biol. & Bioinf. [in Russian]. 11, № 2, 159-169. // Бражников Е.В., Каргатов А.М., Ефимов А.В. (2016) Структура петлевых участков в β-α- и α-β-дугах abCd-единиц в глобулярных белках. Матем. биол. и биоинф. 11, № 2, 159–169. doi: 10.17537/2016.11.159
  79. Tikhonov D.A., Kulikova L.I., Efimov A.V. (2016) Statistical Analysis of the Internal Distances of Helical Pairs in Protein Molecules. Matem. Biol. & Bioinf. [in Russian]. 11, № 2, 170-190. // Тихонов Д.А., Куликова Л.И., Ефимов А.В. (2016) Статистический анализ внутренних расстояний спиральных пар в белковых молекулах. Матем. биол. и биоинф. 11, № 2, 170-190. doi: 10.17537/2016.11.170
  80. Boshkova E.A., Brazhnikov E.V., Efimov A.V. (2016) Relationship between structure and amino acid sequence of strongly twisted and coiled β-hairpins in globular proteins. Mol. Biol. (Moscow). 50, № 5, 777-782. // Бошкова Е.А., Бражников Е.В., Ефимов А.В. (2016) Взаимосвязь между структурой и аминокислотной последовательностью сильно скрученных и изогнутых β-шпилек в глобулярных белках. Молекуляр. биол. 50, № 5, 880-886. doi: 10.7868/S0026898416050049
  81. Tikhonov D.A., Kulikova L.I., Efimov A.V. (2017) The study of interhelical angles in the structural motifs formed by two helices. Matem. Biol. & Bioinf. [in Russian]. 12, № 1, 83–101. // Тихонов Д.А., Куликова Л.И., Ефимов А.В. (2017) Исследование межспиральных углов в структурных мотивах, образованных двумя спиралями. Матем. биол. и биоинф. 12, № 1, 83–101. doi: 10.17537/2017.12.83
  82. Tikhonov D.A., Kulikova L.I., Efimov A.V. (2017) Analysis of the torsion angles between helical axes in pairs of helices in protein molecules. Matem. Biol. & Bioinf. [in Russian]. 12, № 2, 398-410. // Тихонов Д.А., Куликова Л.И., Ефимов А.В. (2017) Анализ торсионных углов между осями спиралей в спиральных парах белковых молекул. Матем. биол. и биоинф. 12, № 2, 398-410. doi: 10.17537/2017.12.398
  83. Efimov A.V. (2017) Structural motifs in which β-strands are clipped together with the П-like module. Proteins. 85, № 10, 1925-1930. doi: 10.1002/prot.25346
  84. Kargatov A.M., Efimov A.V. (2018) Unique combinations of βαβ-units and П-like modules in proteins and features of their amino acid sequences. Mol. Biol. (Moscow). 52, № 1, 43-50. // Каргатов А.М., Ефимов А.В. (2018) Уникальные комбинации βαβ-единиц и П-образных модулей в белках и особенности их аминокислотных последовательностей. Молекуляр. биол. 52, № 1, 43-50. doi: 10.7868/S002689841801007X
  85. Kargatov A.M., Brazhnikov E.V., Efimov A.V. (2018) Structure and features of amino acid sequences of L-modules in SH3-like folds. Mol. Biol. (Moscow). 52, № 6, 929-936. // Каргатов А.М., Бражников Е.В., Ефимов А.В. (2018) L-Модули в SH3-подобных фолдах: структура и особенности последовательностей. Молекуляр. биол. 52, № 6, 1074-1081. doi: 10.1134/S0026898418060095
  86. Efimov A.V. (2020) Handedness of structural units depends on their mutual arrangement in protein structure. J. Biomol. Struct. Dyn. 38, № 2, 604-608. doi: 10.1080/07391102.2019.1580220
  87. Kargatov A.M., Efimov A.V. (2020) Left-handed βαβ-units: frequency of occurrence and arrangement in protein structure. J. Biomol. Struct. Dyn. 38, № 4, 1230-1233. doi: 10.1080/07391102.2019.1591306
  88. Tikhonov D.A., Kulikova L.I., Efimov A.V. (2020) Relationship between the interhelical packing angles and the length of α-helices in proteins. Mol. Biol. (Moscow). 54, № 2, 292-298. // Тихонов Д.А., Куликова Л.И., Ефимов А.В. (2020)  Зависимость торсионных углов между осями α-спиралей от их длины в белках. Молекуляр. биол. 54, № 2, 333-340. doi: 10.31857/S0026898420020159
  89. Efimov A.V., Meshcheryakova O.V., Ryazanov A.G. (2022) Agonists in the extended conformation stabilize the active state of β-adrenoceptors. Biochemistry (Moscow). 87, № 7, 628–639. // Ефимов А.В., Мещерякова О.В., Рязанов А.Г. (2022) Агонисты в вытянутой конформации стабилизируют активированное состояние бета-адренорецепторов. Биохимия. 87, № 7, 933-945.
    doi (eng): 10.1134/S0006297922070057 // doi (rus): 10.31857/S0320972522070089
  90. Rudnev V.R., Nikolsky K.S., Petrovsky D.V., Kulikova L.I., Kargatov A.M., Malsagova K.A., Stepanov A.A., Kopylov A.T., Kaysheva A.L., Efimov A.V. (2022) 3β-Corner stability by comparative molecular dynamics simulations. Int. J. Mol. Sci. 23, 11674. doi: 10.3390/ijms231911674
  91. Rudnev V.R., Petrovsky D.V., Nikolsky K.S., Kulikova L.I., Stepanov A.A., Malsagova K.A., Kaysheva A.L., Efimov A.V. (2022) Biological role of the 3β-corner structural motif in proteins. Processes. 10, 2159. doi: 10.3390/pr10112159
  92. Taldaev A., Rudnev V., Kulikova L., Nikolsky K., Efimov A., Malsagova K., Kaysheva A. (2022) Molecular dynamics study of citrullinated proteins associated with the development of rheumatoid arthritis. Proteomes. 10, 8. doi: 10.3390/proteomes10010008
  93. Brazhnikov E.V., Efimov A.V. (2022) П-like module in OB-fold: structure and features of sequences. Matem. Biol. & Bioinf. [in Russian]. 17, № 2, 441–451. // Бражников Е.В., Ефимов А.В. (2022) П-модуль в OВ-фолде: структура и особенности последовательностей. Матем. биол. и биоинф. 17, № 2, 441–451. doi: 10.17537/2022.17.441
To return to the previous page  To the beginning of page
 
© PSMG IPR RAS 2006-2018
english

русский